Hội chứng ruột kích thích thường gây ra các biểu hiện trái ngược như:

• Rối loạn đại tiện: đau bụng (đau âm ỉ hoặc quặn thành từng cơn có thể kèm mót rặn đi ngoài) khiến bệnh nhân đi ngoài nhiều lần trong ngày (> 3 lần trong 1 ngày) đặc biệt là sau khi uống rượu bia, cà phê hay ăn các thức ăn tanh, sống, lạnh như cá, ốc, cua, gỏi, tiết canh,… nhưng cũng có trường hợp táo bón 2,3 ngày mới đi đại tiện được một lần, đại tiện xong vẫn còn cảm giác đi chưa hết. Người bệnh có thể tham khảo cách điều trị táo bón để giảm nhanh triệu chứng của bệnh.
• Rối loạn tính chất phân: hội chứng này có thể dẫn đến tình trạng đi lỏng (phân nhiều nước) hoặc táo bón (phân rắn khô, khó đi), có khi nửa lỏng nửa táo (vừa có cục nhỏ lổn nhổn, lại có phân loãng kèm theo), cũng có khi lại lúc đi lỏng, lúc đi táo xen kẽ nhau. Đôi khi, phân còn có thể kèm nhày hoặc sống phân (phân còn thức ăn chưa được tiêu hóa).
• Các triệu chứng khác như: đầy bụng, ậm ạch khó chịu, trung tiện nhiều,… Bệnh nhân thường không có tổn thương nào ở đại tràng, các xét nghiệm, nội soi đều cho kết quả bình thường. Các triệu chứng trên thường kéo dài từ 3 tháng đến 1 năm.

Hội chứng ruột kích thích là một rối loạn mạn tính mà nguyên nhân gây ra vẫn chưa được xác định rõ ràng, do đó việc chẩn đoán hội chứng ruột kích thích rất khó khăn. Các phương pháp xét nghiệm chỉ đóng vai trò loại trừ những bệnh lý khác: Xét nghiệm máu, phân, chẩn đoán hình ảnh (như CT scan, chụp X quang ruột non), nội soi ống tiêu hóa dưới,…